潜伏期为14-21d。人工发病试验和自然感染猪巨细胞病毒均可引起相同症状。

妊娠母猪感染后在整个妊娠期未见有发热或其他临床异常，但在病毒血症阶段常常会嗜眠、食欲不振，如首次感染发生于妊娠靥期的母猪，则引起产死胎、木乃伊胎、死产和不育等繁殖障碍。有些仔猪出生后可能未见有临床症状即此亡，有些弱仔表现为贫血、皮肤或勃膜苍白、不同程度的水肿、生长及发育不良，

本病常发生于1-3周龄的仔猪，发病程度与初乳中获得母源性抗体多少有关。5 -lO日龄仔猪基染后，呈现急性经过，其主要症状是呼吸道症状，如打喷嚏、咳嗽、流泪、鼻分泌物增多，继之出现鼻塞、吮乳困难，体重很快减轻。如果无母源抗体的仔猪感染，则可能发生鼻蛆。严重时还可见仔猪颤抖和呼吸闲难等症状，可在发病后5d死亡，一窝仔猪中死淘率可高达25%，其他耐过的仔猪表现生长、发育不良，增重变慢。少数病例发生鼻甲骨的萎缩和颜面变形，据称可能与混合感染有关。据野外长期观察发现，猪巨细胞病毒和支气管败血波氏杆菌之间有协同感染作用。

一些3周龄以内的猪只表现轻度的呼吸道感染的症状，病理检查时有上皮感染的广泛性损害，其发病率与死亡率都很低，若无并发或继发其他感染，3周龄以上的猪感染猪巨细胞病毒后通常不表现出临床症状。但有些初次感染猪巨细胞病毒的成年猪可能与妊娠母猪相似，体温并不升高，但在病毒血症阶段会出现嗜眠、食欲不振，并产生全身性感染的损害。3月龄以上的猪感染，无明显的症状。康复猪常成为隐性感染，长期排毒，是危险的传染源。