根据临床症状及病理变化可做出初步诊断。3—10周龄的猪出现浆液纤维蛋白性到脓性纤维蛋白性多发性浆膜炎和关节炎和肉眼病变预示着猪鼻支原体感染，分离病原微生物并证实没有能引起这些病变的其他微生物。但要注意鉴别诊断，猪鼻支原体是猪多发性浆膜炎的最常见病原。最可能引起相似病变的微生物是嗜血杆菌。此菌也引起猪的急性多发性浆膜炎。区分它们的唯一充分可靠方法是依靠分离病原。但是，这两种疾病的临床症状也有一定区别有助于在现场进行诊断。嗜血杆菌性多发性浆膜炎的体温升高较明显，经常达41.1-41.7℃。分别患此两病时浆膜渗出物的眼观表现也略有不同。嗜血杆菌引起的渗出物在颜色上比猪鼻支原体引起的要白些，稍干燥并分层。渗出物的这些差别是难于分辨的，除非很熟悉这两种疾病。另外，嗜血杆菌性多发性关节炎暴发时的发病率通常较高，如果没有采取迅速处理，可达50% -70%;嗜血杆菌性多发性浆膜炎的死亡率也颇高，常达10%以上。诊断检查用的动物必须在急性期剖杀。死亡动物的自溶性变化能使分离到猪鼻支原体的可能性减少。

猪鼻支原体多发性浆膜炎和关节炎的病猪产生较强的补体结合抗体应答，然而在该病的诊断中很少应用血清学方法。许多外表正常的猪也因猪鼻支原体的亚临床或呼吸道感染而产生抗体。