口蹄疫病毒（F’oot-and-mouth disease virus,FMDV ）属小RNA病毒科( Picornaviridae)口疮疫病毒属( aphthovirus)、

1．形态  病毒粒子为二十面体对称结构，呈球形或六角形，直径23-25nm，无囊膜。

口蹄疫病毒基因组为单股正链RNA，即是mRI\lA，又是负链RNA的模板，约有8500个核苷酸( nts )组成。基因组的基本结构是：VPg-5’ UTR(S-polyC-IRES) -（L蛋白）—结)F~J蛋白PI  c VP4-VP2-VP3-VPI ) –非结构蛋白(P2-P3)—3，UTR-poly (A)，病毒核酸具有感染性。

口蹄疫病毒的外壳蛋白包括4种结构多肽(VP1—VP4)。VPI、VP2和VP3组成衣壳蛋白亚单位，VP4与RNA紧密结合；是病毒粒子的内部成分。VPI全长213个氨基酸，是序列依赖性表位的主要结构基础。

2．病毒变异  口蹄疫病毒的变异性极强，主要由RNA突变造成。目前较有实际意义的检测变异的方法有两种。第一种是病毒核酸测序，检测基因变异情况，主要用于疫源追溯分析。第二种变异检测方法是测定病毒的抗原变化。早期检测抗原变异的方法是利用补体结合试验( CF)测定毒株间的亲缘关系值R。用R值确定被测病毒的亚型归属。

FMDV生物学最大特性是易变而型多，表型变异表现在抗原性和宿主嗜性两方面。以后还会不断出现新的变异型，抗原性方面，目前己发现FMDV有0型、A型、C型、Asia-I型（亚洲1型）、SATI（南非l型）、SAT2（南非2型）、SAT3（南非3型）等7个血清主型。同一血清型内不同毒株的抗原性也不相同，已知有70个以上的亚型，各型之间无交叉免疫，同型内各亚型间交叉免疫力不同，不能保证都有完全的交叉免疫，这导致口蹄疫病毒具有多型性、易变异的特点。亚洲主要有4个型，A型最易变，已有30多个亚型，FMDV在细胞培养、实验动物和自然宿主中都可发生抗原性和毒力等变异，甚至每次流行时，在不同时间、不同地点分离出的病毒株也有不同程度的差别。